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La fondazione dell’Università di Napoli Federico II risale alla generalis lictera dell’Imperatore svevo del 5 giugno 1224. L'Ateneo ha 4 Scuole e 26 Dipartimenti.

Le Scuole si dividono in Scuola di Medicina e Chirurgia, Scuola di Agraria e Medicina Veterinaria, Scuola delle Scienze Umane e Sociali e Scuola Politecnica e delle Scienze di Base, e includono 13 Aree Didattiche ripartite in Agraria, Architettura, Economia, Farmacia, Giurisprudenza, Ingegneria, Medicina e Chirurgia, Medicina Veterinaria, Scienze Biotecnologiche, Scienze MM.FF.NN., Scienze Politiche, Sociologia e Studi Umanistici. Gli studenti, nel loro percorso di apprendimento, possono avvalersi della piattaforma multimediale di Web Learning Federica che conta circa 350 MOOC multidisciplinari.

L'Università ha anche 52 Centri di ricerca e di servizio e 2 Orti botanici.

L’Ateneo conta 108 biblioteche di cui una telematica. Attualmente l’offerta formativa propone 164 Corsi di Laurea, 51 Master Universitari, 38 Dottorati di Ricerca, 66 Scuole di Specializzazione e 25 Corsi di Perfezionamento e la Scuola internazionale di alta formazione e ricerca Scuola Superiore Meridionale (SSM).

L’Ateneo vanta la presenza di prestigiosi musei: il Centro Museale "Centro Musei delle Scienze Naturali e Fisiche" con i Musei di Mineralogia, Zoologia, Antropologia, Paleontologia e Fisica. Il Centro Museale "Musei delle Scienze Agrarie" - MUSA che riunisce il Museo Botanico "Orazio Comes", il Museo "Orto Botanico di Portici", il Museo Anatomo - Zootecnico "Tito Manlio Bettini", il Museo di Mineralogia "Antonio Parascandolo", il Museo di Entomologia "Filippo Silvestri", il Museo delle Macchine Agricole "Carlo Santini" e il Museo Agronomico. Il Museo Antropologico Multimediale e il Museo di Anatomia Veterinaria.

Dal 2004 l'Ateneo forma studenti con il Laboratorio radiofonico F2RadioLab, strumento di comunicazione e orientamento della comunità studentesca.